HUBUNGAN KEKERABATAN BAMBU BERDASARKAN GEN rbcL BERBASIS ANALISIS IN SILICO SEBAGAI BUKTI ADANYA EVOLUSI MOLEKULER

Abstract

Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui hubungan kekerabatan bambu menggunakan sekuen gen rbcL berbasis in silico serta membuktikan evolusi dapat dikaji dengan pendekatan molekuler. Penelitian ini merupakan penelitian deskriptif eksploratif, dilakukan pada bulan Maret sampai Mei 2018 di Kampus I Universitas Nusantara PGRI Kediri. Bahan penelitian berupa sekuens gen rbcL bambu yang diunduh dari laman genbank NCBI. Sekuens gen rbcL yang diunduh disejajarkan dengan aplikasi Notepad, kemudian dipreparasi menggunakan aplikasi BioEdit dan selanjutnya dilakukan konstruksi pohon filogeni dengan aplikasi Mega 6. Konstruksi pohon filogeni bambu menggunakan metode statistik UPGMA, Bootstrap method 1000 kali ulangan dan model pohon Maximum Composite likelihood. Hasil konstruksi pohon filogeni dari 14 spesies bambu berdasarkan gen rbcL, terbentuk group utama dan out group. Group utama terdiri 10 spesies bambu yang membentuk 2 klaster. Klaster 1 terdiri dari C. spectabilis dan C. liebmannii. Klaster 2 terdiri dari 8 spesies bambu yang berkerbatan dekat, yaitu Bambusa bambos, B. mutipex, B. emiensis, Otatea acuminata, O. galuca, Chusquea spectabilis, C. liebmannii, Guadua chacoensis, G. angustifolia dan G. weberbaueri. Out group terdiri dari Phyllostachys edulis, P. nigra, Fargesia nitida dan F. spathacea. Pada pohon filogeni masingmasing spesies yang memiliki tingkat kekerabatan paling dekat dikelompokkan pada cabang yang sama. Berdasarkan homologi sekuens gen rbcL, spesies bambu yang memiliki genus yang sama belum tentu memiliki kekerabatan yang lebih dekat dibandingkan dengan spesies bambu dari genus yang berbeda. Hasil penelitian ini diharapkan dapat menjadi bahan pengembangan sumber belajar biologi SMA.